BIDMC-Forscher entdecken Frühindikatoren für Bauchspeicheldrüsenkrebs

Marker können helfen, die ärzte erkennen, Bauchspeicheldrüsenkrebs, bevor es tödlich wird.

Bauchspeicheldrüsenkrebs ist die vierte führende Ursache von Krebs Tod in den Vereinigten Staaten, ist oft erst in einem späten Stadium, wenn die kurative Behandlung nicht mehr möglich ist. Ein team von Forschern an der Diakonisse Beth Israel Medical Center (BIDMC) hat nun identifiziert und validiert, eine präzise 5-gen-Klassifikator für die Unterscheidung der frühen Bauchspeicheldrüsenkrebs von nicht-malignen Gewebe. Online beschrieben in der Zeitschrift Oncotarget, die Suche nach einem vielversprechenden Fortschritt im Kampf gegen diese in der Regel tödlichen Krankheit.

BIDMC-Forscher entdecken Frühindikatoren für Bauchspeicheldrüsenkrebs

„Bauchspeicheldrüsenkrebs ist eine verheerende Krankheit mit einer Sterblichkeitsrate nahe der Inzidenz-rate“, sagte co-senior-Autor Towia Libermann, PhD, Direktor der Genomik, der Proteomik, der Bioinformatik und der Systembiologie-Center an BIDMC und außerordentlichen Professor von Medizin an Harvard-Medizinischer Fakultät (HMS). „Denn mehr als 90 Prozent der Pankreas-Krebs-Fälle diagnostiziert werden, im metastasierten Stadium, wenn es nur begrenzte therapeutische Möglichkeiten, die frühzeitigere Diagnose wird voraussichtlich einen großen Einfluss auf die Verlängerung der Lebenserwartung für den Patienten. Es wurde keine verlässlichen Marker, die früh Indikatoren und Risikofaktoren für Bauchspeicheldrüsenkrebs, aber diese neue Möglichkeit der Differenzierung zwischen gesunden und malignen Gewebe bietet Hoffnung für frühere Diagnose und Behandlung.“

Die Forscher verwendeten eine Reihe von öffentlich verfügbaren gene expression datasets für Bauchspeicheldrüsenkrebs und entwickelt eine Strategie zur Analyse dieser Datensätze zusammen, nach strengen statistischen Kriterien zu vergleichen, die verschiedene Datensätze aus verschiedenen Laboratorien und unterschiedlichen Plattformen miteinander. Das team wählte dann eine Teilmenge von Daten für die Entwicklung einer Systemsteuerung für die Unterscheidung zwischen Bauchspeicheldrüsenkrebs und gesunden pankreasgewebe und danach angewendet, diese „Bauchspeicheldrüsenkrebs Prädiktor“ auf die verbleibenden Datensätze für unabhängige Validierung zur Bestätigung der Richtigkeit der Marker.

Nach der Demonstration und unabhängig zu überprüfen, ob ein 5-gen Bauchspeicheldrüsenkrebs Prädiktor diskriminiert zwischen Krebszellen und gesunden Gewebe, die Forscher angewendet, der Indikator für Datensätze, die enthalten auch benigne Läsionen der Bauchspeicheldrüse, einschließlich Pankreatitis und frühen Krebs. Der Indikator genau differenziert Pankreas-Krebs, gutartige pankreatische Läsionen, frühzeitig Pankreas-Krebszellen und gesunden Gewebe. Der Indikator erreicht durchschnittlich 95 Prozent Sensitivität und 89% Spezifität bei unterscheidende Bauchspeicheldrüsenkrebs aus nicht-tumor-Proben in vier Trainings-sets und ähnliche Leistung (94% Sensitivität, 90% Spezifität) in fünf unabhängige Validierung der Datensätze.

„Mit innovativen Daten-Normalisierung und gen-Auswahl Ansätze, kombinierten wir die statistische power der multiplen genomischen Studien und maskiert Ihre Variabilität und batch-Effekte zu identifizieren, robuste frühe diagnostische Biomarker von Bauchspeicheldrüsenkrebs,“ sagte ersten Autor Manoj Bhasin, PhD, Co-Direktor des bIDMC der Genomik, der Proteomik, der Bioinformatik und der Systembiologie-Center und Assistant Professor für Medizin an der HMS.

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